82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2367 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  924    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  44.86 
 
 
449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  43.22 
 
 
437 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  44.06 
 
 
445 aa  367  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  44.21 
 
 
433 aa  362  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  42.29 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  43.53 
 
 
450 aa  356  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  43.16 
 
 
447 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  41.36 
 
 
443 aa  344  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  40.56 
 
 
433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  40.77 
 
 
443 aa  307  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  36.84 
 
 
434 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  35.93 
 
 
435 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  35.09 
 
 
435 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  35.56 
 
 
437 aa  252  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  36.63 
 
 
440 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  35.56 
 
 
437 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  37.5 
 
 
443 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  35.11 
 
 
437 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  35.4 
 
 
442 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  35.9 
 
 
442 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  37.5 
 
 
437 aa  244  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  32.64 
 
 
456 aa  237  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  34.52 
 
 
455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  33.78 
 
 
457 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  32.31 
 
 
452 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  35.37 
 
 
464 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  31.59 
 
 
437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  29.93 
 
 
456 aa  195  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  31.13 
 
 
453 aa  183  6e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  29.87 
 
 
463 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  28.7 
 
 
455 aa  177  3e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  42.72 
 
 
210 aa  166  8e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  27.7 
 
 
431 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  30 
 
 
442 aa  157  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  26.49 
 
 
445 aa  145  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  26.92 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.29 
 
 
476 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.43 
 
 
486 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  24.72 
 
 
434 aa  63.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  24.32 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.61 
 
 
393 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  25.17 
 
 
477 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  23.28 
 
 
477 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  23.85 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  24.77 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.14 
 
 
485 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  23.63 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  23.47 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  44.07 
 
 
115 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  24.32 
 
 
403 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  21.3 
 
 
431 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  33.72 
 
 
339 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  23.44 
 
 
388 aa  50.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  24.81 
 
 
379 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  25 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  22.19 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  23.76 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  24.63 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  22.28 
 
 
432 aa  48.5  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0783  hypothetical protein  37.29 
 
 
59 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.735374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0678  hypothetical protein  37.29 
 
 
59 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0114722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  22.5 
 
 
423 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  24.06 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  22.69 
 
 
376 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  23.81 
 
 
406 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  24.6 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  33.72 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  24.91 
 
 
392 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  22.19 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  24.81 
 
 
409 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  25.5 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  23.68 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  22.85 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  23.45 
 
 
406 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  21.13 
 
 
474 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1901  AAA ATPase  30.77 
 
 
396 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0547156 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  22.48 
 
 
389 aa  43.5  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  31.4 
 
 
418 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  23.75 
 
 
423 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  24.64 
 
 
437 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  26.21 
 
 
360 aa  43.1  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>