48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01108 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  69.18 
 
 
442 aa  644    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  71.43 
 
 
440 aa  669    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  69.05 
 
 
437 aa  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  71.13 
 
 
437 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  70.21 
 
 
437 aa  654    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  70.21 
 
 
437 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  915    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  71.56 
 
 
442 aa  672    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  36.59 
 
 
449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  36.24 
 
 
437 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  37.5 
 
 
448 aa  249  6e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  34.15 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  34.24 
 
 
443 aa  233  6e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  32.58 
 
 
445 aa  228  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  35.68 
 
 
445 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  36.01 
 
 
433 aa  226  6e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  32.59 
 
 
447 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  36.1 
 
 
433 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.18 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  32.28 
 
 
434 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  33.26 
 
 
456 aa  193  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  31.76 
 
 
435 aa  189  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  31.83 
 
 
435 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  27.77 
 
 
437 aa  182  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  31.13 
 
 
457 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  30.88 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  32.61 
 
 
464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  29.49 
 
 
452 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  30.22 
 
 
456 aa  157  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  28.94 
 
 
453 aa  141  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  27.23 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  26.47 
 
 
463 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  26.12 
 
 
455 aa  124  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.46 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  34.34 
 
 
210 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  23.5 
 
 
445 aa  99  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  26.8 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  27.22 
 
 
430 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  21.51 
 
 
426 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  26.7 
 
 
413 aa  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  28.71 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  25.36 
 
 
477 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  23.69 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  27.5 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  27.5 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  56.25 
 
 
115 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  24.86 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  25.96 
 
 
487 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>