87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18710 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  100 
 
 		 433 aa  893    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  65.13 
 
 		 443 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  47.89 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  48.12 
 
 		 437 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  46.03 
 
 		 445 aa  411  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  46.28 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  45.24 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  44.78 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  43.71 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  44.21 
 
 		 448 aa  362  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  41.57 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  38.19 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  37.73 
 
 		 435 aa  267  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  37.27 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  36.01 
 
 		 443 aa  226  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  34.23 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  33.91 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  33.82 
 
 		 437 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  34.23 
 
 		 437 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  33.99 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  33.99 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  32.85 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  31.87 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  30.48 
 
 		 456 aa  203  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  34.14 
 
 		 457 aa  202  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  33.97 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  32.37 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  31.16 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  27.03 
 
 		 431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  39.71 
 
 		 210 aa  163  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  30.34 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  29.19 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.88 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  28.3 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  27.85 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  25.95 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  26.4 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  24.07 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  23.02 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  27.03 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  23.79 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  23.11 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.35 
 
 		 476 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  24.91 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.2 
 
 		 486 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  25.19 
 
 		 390 aa  53.9  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  23.44 
 
 		 386 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  22.55 
 
 		 392 aa  53.5  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  22.22 
 
 		 394 aa  53.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.88 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  23.45 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  43.14 
 
 		 115 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  23.65 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  27.41 
 
 		 360 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  30.17 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  21.94 
 
 		 474 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  23.13 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  22.91 
 
 		 396 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  24.54 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  23.75 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  24.23 
 
 		 390 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  23.51 
 
 		 376 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  23.26 
 
 		 380 aa  50.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  22.61 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  24.11 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  22.45 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.11 
 
 		 506 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  23.17 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  23.51 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  29.61 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  22.41 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  23.36 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  22.08 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  22.14 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  23.71 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  21.92 
 
 		 406 aa  47.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  31.65 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  21.82 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  23.9 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  21.16 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  23.72 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  22.04 
 
 		 378 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  21.43 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  25.11 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  33.71 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  27.57 
 
 		 417 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0367  hypothetical protein  28.88 
 
 		 441 aa  43.1  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.795578  normal  0.299565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>