46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0298 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  84.16 
 
 		 442 aa  788    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  83.72 
 
 		 440 aa  779    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  909    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  86.27 
 
 		 437 aa  805    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  85.81 
 
 		 437 aa  801    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  86.5 
 
 		 437 aa  808    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  72.54 
 
 		 442 aa  682    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  69.05 
 
 		 443 aa  648    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  37.5 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  33.48 
 
 		 450 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  33.86 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  33.56 
 
 		 437 aa  223  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  32.81 
 
 		 447 aa  222  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  33.18 
 
 		 445 aa  220  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  34.16 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  35.21 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.82 
 
 		 433 aa  213  7.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  36.01 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.72 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  31.64 
 
 		 456 aa  199  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  31.46 
 
 		 434 aa  186  9e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  31.37 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  30.59 
 
 		 455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  30.72 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  31.4 
 
 		 457 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  30.79 
 
 		 435 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  30.07 
 
 		 464 aa  166  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  30.38 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  29.02 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  28.6 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  26.9 
 
 		 431 aa  126  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  28.3 
 
 		 453 aa  119  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  36.68 
 
 		 210 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  25.59 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  24.12 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  24.68 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  23.53 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  25.67 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  64.52 
 
 		 115 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  27.27 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  24.41 
 
 		 413 aa  47  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  26.74 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  23.21 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  24.8 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  26.2 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  26.74 
 
 		 423 aa  43.1  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>