58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0143 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  90.99 
 
 		 434 aa  815    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  96.32 
 
 		 435 aa  861    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  891    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  42.68 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  37.94 
 
 		 455 aa  283  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  36.38 
 
 		 457 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  38.21 
 
 		 452 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  37.73 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  36.64 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  35.09 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  36.87 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  35.23 
 
 		 443 aa  239  5e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  32.5 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  34.38 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  36.12 
 
 		 450 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  34.23 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  35.32 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  34.32 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  34.57 
 
 		 463 aa  216  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  32.81 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  32.52 
 
 		 437 aa  199  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  32.06 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  32.74 
 
 		 437 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  32.21 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  31.76 
 
 		 443 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  30.72 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  28.6 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  31.17 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.25 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  27.4 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  34.98 
 
 		 210 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  24.94 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  23.52 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  25.61 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  24.09 
 
 		 431 aa  100  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.75 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  24.42 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.26 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  23.74 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  25.35 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  28.93 
 
 		 477 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  24.16 
 
 		 380 aa  51.2  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.8 
 
 		 486 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  26.4 
 
 		 434 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  27.06 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  25.72 
 
 		 360 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  25.71 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  22.81 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  22.14 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  28.47 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  27.47 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  23.26 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  20.44 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.62 
 
 		 485 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  32.53 
 
 		 115 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  22.45 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.4 
 
 		 426 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>