57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03690 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  100 
 
 
443 aa  911    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  43.84 
 
 
443 aa  375  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  43.71 
 
 
433 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  41.42 
 
 
449 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  40.05 
 
 
437 aa  334  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  41.5 
 
 
445 aa  327  3e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  41.08 
 
 
450 aa  326  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  40.32 
 
 
447 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  40.77 
 
 
448 aa  307  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  36.96 
 
 
445 aa  301  2e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  35.91 
 
 
434 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  33.49 
 
 
433 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  35.31 
 
 
435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  35.23 
 
 
435 aa  239  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  34.95 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  35.1 
 
 
440 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  34.56 
 
 
464 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  34.65 
 
 
437 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  32.79 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  34.64 
 
 
437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  33.18 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  35.22 
 
 
437 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  31.76 
 
 
455 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  33.41 
 
 
442 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  33.72 
 
 
437 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  33.87 
 
 
442 aa  206  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  32.55 
 
 
452 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  30.79 
 
 
456 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  28.42 
 
 
463 aa  166  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  31.45 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  42.13 
 
 
210 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  26.7 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  27.96 
 
 
445 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  27.87 
 
 
455 aa  144  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  29.31 
 
 
453 aa  139  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.55 
 
 
442 aa  136  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  24.3 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.72 
 
 
485 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  23.54 
 
 
458 aa  57.4  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  25 
 
 
409 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  24.94 
 
 
392 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  22.85 
 
 
376 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  37.25 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  25.45 
 
 
415 aa  50.1  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  22.76 
 
 
486 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  25.41 
 
 
427 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  24.26 
 
 
421 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  22.4 
 
 
393 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.57 
 
 
476 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  24.15 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  23.22 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  26.06 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  34.34 
 
 
474 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  23.76 
 
 
426 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  23.76 
 
 
471 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  33.33 
 
 
406 aa  43.5  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.47 
 
 
506 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>