41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3125 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  72.54 
 
 		 437 aa  682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  72.69 
 
 		 437 aa  671    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  72.45 
 
 		 437 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  71.56 
 
 		 443 aa  672    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  914    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  72.73 
 
 		 440 aa  681    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  72.69 
 
 		 437 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  71.17 
 
 		 442 aa  660    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  35.9 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  32.96 
 
 		 450 aa  236  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  34.29 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  31.85 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  33.71 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  34.06 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.65 
 
 		 443 aa  210  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.87 
 
 		 443 aa  206  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  33.81 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  31.32 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  32.37 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  32.52 
 
 		 456 aa  190  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  30.04 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  30.48 
 
 		 435 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  31.17 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  31.44 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  28.95 
 
 		 437 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  30.61 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  30.42 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  29.76 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  28.54 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  27.42 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  28.44 
 
 		 463 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  26.91 
 
 		 453 aa  107  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  32.02 
 
 		 210 aa  97.8  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  25.35 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.92 
 
 		 390 aa  90.1  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  25.83 
 
 		 445 aa  86.7  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  24.03 
 
 		 455 aa  86.7  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  27.54 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  23.21 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  32.21 
 
 		 196 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.52 
 
 		 476 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>