92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0180 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  929    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  79.78 
 
 
457 aa  775    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  49.21 
 
 
452 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  40.58 
 
 
464 aa  344  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  38.5 
 
 
456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  36.77 
 
 
463 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  37.94 
 
 
435 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  38.86 
 
 
434 aa  279  9e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  37.24 
 
 
435 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  34.44 
 
 
449 aa  239  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  34.44 
 
 
437 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  34.52 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  30.35 
 
 
445 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  32.43 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  31.03 
 
 
445 aa  217  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  34.36 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.91 
 
 
433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  28.7 
 
 
447 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  31.76 
 
 
443 aa  211  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  33.48 
 
 
433 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  30.6 
 
 
442 aa  190  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  30.45 
 
 
437 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  30.17 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  31.43 
 
 
440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  30.59 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  29.59 
 
 
437 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  30.88 
 
 
443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  29.19 
 
 
437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  29.76 
 
 
442 aa  160  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  29.26 
 
 
456 aa  160  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  25.56 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  26.53 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  24.72 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  25.06 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  24.62 
 
 
445 aa  108  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  33.5 
 
 
210 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  25.25 
 
 
408 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  26.2 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  25.25 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  26.86 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  22.9 
 
 
378 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  26.18 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  24.35 
 
 
388 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  28.25 
 
 
435 aa  60.5  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  24.66 
 
 
390 aa  60.1  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.21 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  23.92 
 
 
458 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  24.76 
 
 
432 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  25 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  24.3 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  23.54 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.88 
 
 
485 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  24.74 
 
 
415 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  24.33 
 
 
376 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  23.75 
 
 
421 aa  53.1  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  23 
 
 
415 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  23.87 
 
 
474 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  24.03 
 
 
409 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.29 
 
 
426 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.58 
 
 
394 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  22.73 
 
 
486 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  24.07 
 
 
436 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  23.54 
 
 
408 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  26.52 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  26.4 
 
 
411 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  28.17 
 
 
477 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  26.18 
 
 
412 aa  50.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  26.62 
 
 
412 aa  50.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.71 
 
 
476 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  25.99 
 
 
426 aa  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  21.54 
 
 
445 aa  49.3  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  23.35 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  25 
 
 
460 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  23.16 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  24.15 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  25 
 
 
460 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  25.55 
 
 
471 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  24.62 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  24.45 
 
 
421 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  24.26 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  22.6 
 
 
384 aa  47.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  29.38 
 
 
477 aa  47.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  45.28 
 
 
115 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.34 
 
 
506 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  26.17 
 
 
481 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  25.13 
 
 
392 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  22.89 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.09 
 
 
486 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  24.76 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  23.55 
 
 
339 aa  44.3  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  22.81 
 
 
415 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  23.5 
 
 
406 aa  43.5  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>