60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0593 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  90.99 
 
 		 435 aa  820    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  891    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  90.95 
 
 		 435 aa  817    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  42.68 
 
 		 456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  38.86 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  37.14 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  38.21 
 
 		 452 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  36.84 
 
 		 448 aa  266  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  36.64 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  37.27 
 
 		 433 aa  260  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  37.19 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  35.91 
 
 		 443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  32.87 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  34.38 
 
 		 445 aa  236  6e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  34.51 
 
 		 449 aa  236  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  36.12 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  34.07 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  33.79 
 
 		 433 aa  222  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  35.07 
 
 		 447 aa  222  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  34.15 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  33.71 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  33.18 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  32.06 
 
 		 440 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  32.74 
 
 		 437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  32.21 
 
 		 437 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  32.28 
 
 		 443 aa  196  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  31.46 
 
 		 437 aa  192  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  30.72 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  29.28 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  25.71 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  26.28 
 
 		 456 aa  130  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  26.49 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  34.48 
 
 		 210 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  23.71 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  25.66 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  23.92 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.75 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  24.88 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  23.79 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  27.93 
 
 		 434 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.78 
 
 		 476 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  27.34 
 
 		 360 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  26.12 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  23.38 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  26.03 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.61 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  23.16 
 
 		 477 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  26.98 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  27.47 
 
 		 383 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  23.72 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  22.62 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  28.83 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  25.7 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  23.6 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.61 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  22.25 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  24.55 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  25.47 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  28.27 
 
 		 481 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  27.73 
 
 		 477 aa  43.1  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>