67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1555 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1555  AAA ATPase  100 
 
 
387 aa  789    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.536767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1506  AAA ATPase  77 
 
 
387 aa  624  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.235855  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  31.3 
 
 
401 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  31.03 
 
 
401 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4144  AAA ATPase  26.71 
 
 
429 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0805  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase; type iidhqase)  28.47 
 
 
399 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.939667  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2166  AAA ATPase  25.94 
 
 
413 aa  112  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0785  AAA ATPase  28.34 
 
 
399 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.313428  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0547  hypothetical protein  23.92 
 
 
398 aa  101  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  26.88 
 
 
477 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.9 
 
 
506 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.37 
 
 
486 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.48 
 
 
485 aa  67.4  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  25 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  22.73 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.1 
 
 
476 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  22.73 
 
 
428 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  23.94 
 
 
430 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  25.17 
 
 
477 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  24.55 
 
 
413 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  31.72 
 
 
390 aa  60.1  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  25.36 
 
 
431 aa  59.7  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  24.04 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  25.78 
 
 
430 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  22.87 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  23.77 
 
 
427 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  21.68 
 
 
487 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  27.84 
 
 
474 aa  53.1  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  27.69 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  22.77 
 
 
427 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  24.19 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  29.76 
 
 
406 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  22.63 
 
 
414 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  24.21 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  22.4 
 
 
486 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  30.72 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  23.95 
 
 
388 aa  50.4  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  19.88 
 
 
427 aa  49.7  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  26.24 
 
 
421 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  26.35 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  21.25 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  25 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  22.78 
 
 
408 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  26.67 
 
 
543 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  26.67 
 
 
543 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  23.96 
 
 
410 aa  47  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  22.54 
 
 
417 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  22.99 
 
 
399 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32 
 
 
639 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.38 
 
 
738 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  26.92 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  22.16 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  31.2 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  24.86 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  21.63 
 
 
423 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  22.16 
 
 
426 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  40.58 
 
 
769 aa  44.3  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31 
 
 
620 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  26.4 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  22.45 
 
 
428 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  36.11 
 
 
781 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  22.26 
 
 
481 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  22.52 
 
 
392 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  29.14 
 
 
754 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  36.23 
 
 
450 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  28.12 
 
 
376 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41790  predicted protein  35.09 
 
 
448 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>