90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0321 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  100 
 
 
465 aa  938    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  47.07 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1840  hypothetical protein  29.6 
 
 
501 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  29.23 
 
 
460 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  29.23 
 
 
460 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0367  hypothetical protein  29.39 
 
 
441 aa  154  4e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.795578  normal  0.299565 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  28.19 
 
 
392 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1373  hypothetical ATPase  26.59 
 
 
436 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.96308  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1433  hypothetical protein  26.36 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2288  AAA ATPase  26.58 
 
 
409 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.551072  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  25.81 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0961  hypothetical protein  25.91 
 
 
518 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.416068  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1956  hypothetical protein  26.52 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0242  hypothetical ATPase  26.26 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0233  hypothetical protein  24.81 
 
 
380 aa  97.1  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.230022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.87 
 
 
486 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.79 
 
 
476 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.88 
 
 
485 aa  89.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.11 
 
 
506 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  23.13 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  24.4 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  25.94 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  25.49 
 
 
437 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  22.89 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  25.12 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  24.45 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  24.39 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  27.19 
 
 
486 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  27.29 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  25.65 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  25.65 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  22.79 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  22.79 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  26.91 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  30.13 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  22.79 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  24.19 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  28.57 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  25.58 
 
 
428 aa  67  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  29.69 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  24.93 
 
 
432 aa  66.6  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  21.99 
 
 
417 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  25.54 
 
 
427 aa  63.9  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  24.56 
 
 
427 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  24.24 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  25.81 
 
 
466 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  26.54 
 
 
543 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  26.54 
 
 
543 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  27.8 
 
 
423 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  25.96 
 
 
481 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  23.18 
 
 
420 aa  60.5  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  23.18 
 
 
431 aa  60.5  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.79 
 
 
390 aa  60.1  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  22.76 
 
 
388 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  24.09 
 
 
399 aa  60.1  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  23.95 
 
 
400 aa  60.1  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  28.12 
 
 
423 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  26.33 
 
 
431 aa  58.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  28.37 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  23.81 
 
 
376 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  22.87 
 
 
418 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  21.55 
 
 
416 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  30.18 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  24.44 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  23.6 
 
 
430 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  25.08 
 
 
425 aa  53.9  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  24.87 
 
 
435 aa  53.5  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  26.71 
 
 
423 aa  53.5  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  24.68 
 
 
456 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  23.05 
 
 
542 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  24.2 
 
 
403 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  23.53 
 
 
378 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  20.9 
 
 
464 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  24.11 
 
 
417 aa  51.6  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  28.28 
 
 
415 aa  50.1  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  27.44 
 
 
434 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  25.27 
 
 
427 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  24.32 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  23.22 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  23.96 
 
 
462 aa  47.8  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  24.56 
 
 
380 aa  47  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  23.71 
 
 
360 aa  47  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  21.25 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  22 
 
 
413 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  23.67 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  28.22 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_002950  PG0547  hypothetical protein  24.34 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  22.02 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  26.47 
 
 
390 aa  44.3  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  23.84 
 
 
412 aa  43.1  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>