109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2796 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  100 
 
 
437 aa  904    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  52.51 
 
 
542 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  36.19 
 
 
431 aa  276  4e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  37.93 
 
 
466 aa  276  7e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  36.85 
 
 
427 aa  273  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  38.04 
 
 
431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  36.83 
 
 
428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  38.04 
 
 
420 aa  270  4e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  35.98 
 
 
428 aa  264  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  34.36 
 
 
427 aa  240  4e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  35.28 
 
 
429 aa  224  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  33.92 
 
 
403 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  33.87 
 
 
430 aa  209  8e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  32.37 
 
 
471 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  32.37 
 
 
426 aa  207  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  30.39 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  30 
 
 
423 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  34.84 
 
 
423 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  29.7 
 
 
423 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  29.23 
 
 
423 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  32.86 
 
 
430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  32.26 
 
 
414 aa  190  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  33.25 
 
 
431 aa  189  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  31.07 
 
 
417 aa  187  4e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  31.21 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  31.21 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  33.18 
 
 
427 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  31.94 
 
 
421 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  31.77 
 
 
432 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  30.65 
 
 
415 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  29.77 
 
 
413 aa  170  5e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  32.85 
 
 
434 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  31.14 
 
 
410 aa  168  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  30.12 
 
 
435 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  28.6 
 
 
413 aa  160  4e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  28.37 
 
 
399 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  32.05 
 
 
413 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  31.44 
 
 
410 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  30.64 
 
 
406 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  29.93 
 
 
417 aa  146  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  27.85 
 
 
425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  27.94 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  27.94 
 
 
427 aa  134  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  25.58 
 
 
400 aa  129  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  27.9 
 
 
418 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  25.37 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  25.25 
 
 
441 aa  108  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  28.49 
 
 
393 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  27.41 
 
 
392 aa  103  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  26.95 
 
 
360 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  22.71 
 
 
445 aa  89.7  8e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0196  hypothetical protein  23.99 
 
 
431 aa  85.1  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  33.95 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  25.49 
 
 
465 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  22.44 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  23.84 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  24.14 
 
 
477 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  23.8 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.07 
 
 
476 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.66 
 
 
486 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  22.71 
 
 
377 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.39 
 
 
506 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  23.88 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  26.13 
 
 
486 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  23.77 
 
 
388 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.3 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  22.44 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  23.93 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  25.96 
 
 
481 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  22.98 
 
 
426 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  23.65 
 
 
382 aa  63.5  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.38 
 
 
485 aa  63.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.1 
 
 
376 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  21.63 
 
 
388 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  24.53 
 
 
458 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  23.21 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  26.95 
 
 
392 aa  57.8  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  23.38 
 
 
380 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  22.79 
 
 
427 aa  56.6  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  22.79 
 
 
427 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  21.99 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  22.79 
 
 
400 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  19.03 
 
 
408 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  24.86 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.15 
 
 
386 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0142  putative AAA+ superfamily ATPase  33.64 
 
 
159 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.085374  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  23.4 
 
 
379 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  30.07 
 
 
543 aa  50.8  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  30.07 
 
 
543 aa  50.8  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  24.07 
 
 
389 aa  50.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  23.72 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  25.53 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  21.99 
 
 
380 aa  47.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  21.29 
 
 
406 aa  47  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  26.07 
 
 
413 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  22.55 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  22.55 
 
 
398 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  22.87 
 
 
416 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  23.68 
 
 
408 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  22.35 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>