75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1618 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  100 
 
 
396 aa  814    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  32.16 
 
 
406 aa  209  9e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  31.25 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  30.27 
 
 
418 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  30.26 
 
 
399 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  27.62 
 
 
431 aa  117  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  27.62 
 
 
420 aa  117  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  25.13 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  23.34 
 
 
441 aa  103  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  25.62 
 
 
425 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  27.7 
 
 
421 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  21.7 
 
 
466 aa  96.7  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  23.46 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0196  hypothetical protein  25.13 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  25.56 
 
 
424 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  25.56 
 
 
428 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  25 
 
 
427 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  20.91 
 
 
445 aa  88.6  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  22.47 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  24.73 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  26.24 
 
 
431 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  24.53 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  21.88 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  24.3 
 
 
388 aa  86.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  22.83 
 
 
462 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  24.75 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  24.74 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  24.2 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  23.77 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  23.72 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  24.66 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  23.81 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  22.75 
 
 
471 aa  79.7  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  22.75 
 
 
426 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  25.56 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  22.75 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  24.62 
 
 
427 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  23.95 
 
 
431 aa  76.3  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  22.91 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  26.15 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  21.29 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  23.35 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  23.79 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  22.34 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  22.71 
 
 
542 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  21.7 
 
 
477 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  20.8 
 
 
427 aa  63.5  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  23.24 
 
 
400 aa  63.2  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  23.66 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0142  putative AAA+ superfamily ATPase  29.58 
 
 
159 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.085374  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  23.76 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  21.9 
 
 
477 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  23.1 
 
 
392 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  31.88 
 
 
196 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  25.91 
 
 
458 aa  54.3  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  23.31 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  24.02 
 
 
434 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  24.45 
 
 
388 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  23.3 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  20.33 
 
 
486 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  20.73 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  24.57 
 
 
410 aa  50.4  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  23.41 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  25.51 
 
 
430 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  23.49 
 
 
388 aa  50.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  25.13 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  20.38 
 
 
506 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  20.86 
 
 
394 aa  47.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  21.63 
 
 
407 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  26.75 
 
 
460 aa  46.6  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  26.75 
 
 
460 aa  46.6  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  21.19 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  20.66 
 
 
378 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.3 
 
 
476 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  20 
 
 
378 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>