77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0233 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0233  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  770    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.230022 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0367  hypothetical protein  41.21 
 
 		 441 aa  272  6e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.795578  normal  0.299565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2288  AAA ATPase  39.23 
 
 		 409 aa  247  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.551072  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  36.48 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1840  hypothetical protein  27.63 
 
 		 501 aa  170  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1433  hypothetical protein  29.48 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1373  hypothetical ATPase  29.48 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.96308  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  28.24 
 
 		 460 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  28.24 
 
 		 460 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  29.56 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  24.81 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  26 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0237  hypothetical protein  36.59 
 
 		 219 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0242  hypothetical ATPase  24.82 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1956  hypothetical protein  24.82 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  29.55 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.63 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.54 
 
 		 486 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.62 
 
 		 506 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.1 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  25.59 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  26.38 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  22.93 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  25.15 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  25.45 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  26.35 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  24.73 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  25.07 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  24.32 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  24.7 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  25.68 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  28.57 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  25.79 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  27.93 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  23.66 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  23.08 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  22.77 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  22.77 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  26.18 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  23.39 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  24.71 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  23.39 
 
 		 428 aa  53.1  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  24.81 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0961  hypothetical protein  25.14 
 
 		 518 aa  53.1  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.416068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  26.02 
 
 		 399 aa  52.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  24.44 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  26.88 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  24.76 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  22.19 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  23.72 
 
 		 462 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  25.41 
 
 		 481 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  22.95 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  24.16 
 
 		 477 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  25.59 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  21.39 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  23.6 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  24.93 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  22.82 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  25.07 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  23.2 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  23.86 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  23.39 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  25.2 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  24.87 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  25.2 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  26.89 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  26.89 
 
 		 419 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  28.52 
 
 		 376 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  23.58 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  25.28 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  24.55 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  23.36 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  22.99 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  27.39 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  25.56 
 
 		 542 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  24.52 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  25.27 
 
 		 415 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>