78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1040 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  100 
 
 		 421 aa  855    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2288  AAA ATPase  32.47 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.551072  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1840  hypothetical protein  26.88 
 
 		 501 aa  159  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125507  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  29.04 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  29.64 
 
 		 458 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0367  hypothetical protein  32.07 
 
 		 441 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.795578  normal  0.299565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  25.81 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  30.18 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  30.18 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0233  hypothetical protein  29.59 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.230022 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1433  hypothetical protein  25.5 
 
 		 436 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1373  hypothetical ATPase  25.28 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.96308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  29.08 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  25.84 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  26.37 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  25.13 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  27.2 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  26.22 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  28.77 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  26.03 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.82 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  26.79 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.64 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  25.23 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  26.91 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  25.12 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  27.64 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1956  hypothetical protein  24.54 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0242  hypothetical ATPase  25.19 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  26.69 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  26.5 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  24.71 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  23.3 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  22.1 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  26.76 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  23.96 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  26.11 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  23.23 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  23.74 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  24.06 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0961  hypothetical protein  24.73 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.416068  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  25.71 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  31.39 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  27.89 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  27.89 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  25.19 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  26.1 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  23.79 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  24.91 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  27.07 
 
 		 466 aa  54.7  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  25.36 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  23.27 
 
 		 402 aa  54.3  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  25.49 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  19.48 
 
 		 506 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  25.42 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  24.86 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  23.2 
 
 		 400 aa  53.5  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  24.86 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  25.35 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  24.36 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  23.43 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  25.14 
 
 		 431 aa  50.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  25.14 
 
 		 420 aa  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  24.48 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  25.41 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  25.13 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  24.62 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  22.55 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  22.57 
 
 		 432 aa  47.4  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  23.71 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  26.27 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  23.63 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  27.7 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  22.58 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  24.05 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  23.12 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0237  hypothetical protein  32.99 
 
 		 219 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>