117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0984 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  830    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  57.61 
 
 
418 aa  485  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  52.1 
 
 
398 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  35.66 
 
 
399 aa  256  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  32.16 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  29.37 
 
 
445 aa  186  5e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  30.18 
 
 
441 aa  179  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  28.93 
 
 
466 aa  166  9e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  31.3 
 
 
423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  32.61 
 
 
431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  32.61 
 
 
420 aa  163  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  29.48 
 
 
414 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  30.92 
 
 
425 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0196  hypothetical protein  26.16 
 
 
431 aa  152  1e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  32.27 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  30.64 
 
 
437 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  31.44 
 
 
423 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  29.23 
 
 
428 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  27.07 
 
 
435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0142  putative AAA+ superfamily ATPase  49.32 
 
 
159 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.085374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  28.46 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  30.95 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  30.48 
 
 
427 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  29.59 
 
 
423 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  31.15 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  30.68 
 
 
471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  30.49 
 
 
431 aa  130  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  30.68 
 
 
426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  26.95 
 
 
432 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  28.64 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  31.1 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  30 
 
 
429 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  28.61 
 
 
417 aa  125  9e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  28.98 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  35.54 
 
 
410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  28.65 
 
 
428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  29.52 
 
 
427 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  28.65 
 
 
424 aa  121  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  27.91 
 
 
388 aa  120  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  29.47 
 
 
403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  29.44 
 
 
430 aa  119  9e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  26.65 
 
 
542 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  27.81 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  27.38 
 
 
392 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  28.53 
 
 
427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  26.83 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  27.9 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  27.35 
 
 
413 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  30.72 
 
 
360 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  27.55 
 
 
415 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  26.04 
 
 
430 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  25.62 
 
 
400 aa  98.2  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  26.07 
 
 
477 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  23.32 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  27.4 
 
 
434 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.71 
 
 
485 aa  89.7  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  34.44 
 
 
196 aa  86.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  24.16 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  26.48 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  24.01 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.07 
 
 
506 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  23.17 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  23.18 
 
 
477 aa  80.5  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  26.15 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  26.15 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  22.59 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  22.89 
 
 
465 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  24.36 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  23.05 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  23.05 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.56 
 
 
476 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  24.31 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.63 
 
 
486 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  21.2 
 
 
385 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  23.26 
 
 
436 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  22.94 
 
 
409 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  23.2 
 
 
382 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.08 
 
 
394 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  21.56 
 
 
426 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  24.67 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  24.23 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  24.16 
 
 
486 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  23.05 
 
 
415 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  24.04 
 
 
487 aa  59.7  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  23.12 
 
 
481 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  24.13 
 
 
415 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  26.67 
 
 
402 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  23.48 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  21.27 
 
 
402 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  23.9 
 
 
454 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  24.08 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  24.32 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  26.34 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  21.59 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.58 
 
 
386 aa  54.3  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  25.93 
 
 
458 aa  53.5  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  30.43 
 
 
460 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  30.43 
 
 
460 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  23.43 
 
 
421 aa  51.6  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>