70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1112 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  374  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  60.54 
 
 
212 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  54.05 
 
 
188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  51.76 
 
 
225 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  55 
 
 
298 aa  156  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  52.82 
 
 
291 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  47.64 
 
 
235 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  52.47 
 
 
203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  54.73 
 
 
223 aa  153  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  55.63 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  51.41 
 
 
178 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  48.97 
 
 
368 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  48.25 
 
 
284 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  54.86 
 
 
167 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  48.59 
 
 
187 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  50.33 
 
 
242 aa  140  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  53.47 
 
 
309 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  49.37 
 
 
216 aa  138  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  51.05 
 
 
347 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  47.97 
 
 
208 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  43.87 
 
 
245 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  49.65 
 
 
213 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  49.07 
 
 
210 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  57.34 
 
 
196 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  47.06 
 
 
946 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  47.92 
 
 
279 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  48.61 
 
 
279 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  50.34 
 
 
267 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  41.72 
 
 
235 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  45 
 
 
247 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  47.59 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  45 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  44.3 
 
 
276 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  46.98 
 
 
235 aa  117  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  38.69 
 
 
321 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  43.97 
 
 
226 aa  107  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  40.27 
 
 
220 aa  95.9  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  38.97 
 
 
222 aa  92  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  39.73 
 
 
218 aa  89  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  39.87 
 
 
202 aa  84.3  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  37.06 
 
 
156 aa  82  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  37.5 
 
 
243 aa  78.2  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  39.58 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  34.27 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  33.87 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  36.02 
 
 
384 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  32.16 
 
 
228 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  33.08 
 
 
238 aa  57.8  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  32.86 
 
 
251 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  32.73 
 
 
260 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  32.62 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  35.71 
 
 
375 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  34.23 
 
 
239 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  31.76 
 
 
228 aa  55.5  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  27.17 
 
 
248 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  30.82 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  35.54 
 
 
257 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  28.65 
 
 
238 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  34.01 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  32.56 
 
 
244 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  32.81 
 
 
243 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  31.54 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  41.46 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  29.58 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  35.53 
 
 
262 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  32.52 
 
 
350 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  37.19 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  29.38 
 
 
234 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  36.75 
 
 
288 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  32.58 
 
 
298 aa  41.6  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>