62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3985 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
223 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  82.22 
 
 
225 aa  361  6e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  56.76 
 
 
212 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  45.1 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  52.63 
 
 
188 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  50.67 
 
 
214 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  53.59 
 
 
192 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  48.98 
 
 
203 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  47.24 
 
 
245 aa  141  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  45.7 
 
 
178 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  52 
 
 
196 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  51.72 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  48.61 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  46 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  48.08 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  43.24 
 
 
368 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  46.94 
 
 
946 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  48.97 
 
 
309 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  45.77 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  48.25 
 
 
347 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  46.67 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  45.77 
 
 
247 aa  128  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  39.02 
 
 
235 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  46.01 
 
 
216 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  46.67 
 
 
279 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  42.18 
 
 
284 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  44.83 
 
 
187 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  43.06 
 
 
298 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  43.54 
 
 
291 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  45.24 
 
 
213 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  46.58 
 
 
167 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  43.31 
 
 
242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  37.93 
 
 
321 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  41.06 
 
 
235 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  38.46 
 
 
267 aa  99.4  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  38.67 
 
 
220 aa  93.2  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  36.88 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  39.1 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  38.19 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  39.01 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  37.75 
 
 
156 aa  84.7  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  35.43 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  35.2 
 
 
144 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  32.74 
 
 
238 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  34.45 
 
 
194 aa  58.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  32.67 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  31.25 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  32.35 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  33.54 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  32.35 
 
 
260 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  30 
 
 
375 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  29.78 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  32.9 
 
 
298 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  30.23 
 
 
384 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  32.84 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  30.91 
 
 
244 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  30.2 
 
 
521 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  28.57 
 
 
302 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  29.68 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  28.09 
 
 
298 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  27.92 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  27.11 
 
 
556 aa  41.6  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>