55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1052 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  55.98 
 
 
298 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  58.22 
 
 
368 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  51.68 
 
 
284 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  47.5 
 
 
188 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  50.97 
 
 
212 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  50.66 
 
 
192 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  48.97 
 
 
214 aa  142  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  51.88 
 
 
196 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  43.64 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  37.33 
 
 
225 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  40.36 
 
 
245 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  46.98 
 
 
203 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  43.56 
 
 
309 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  42.58 
 
 
279 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  42.86 
 
 
235 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  48.03 
 
 
214 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  45.7 
 
 
946 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  47.26 
 
 
347 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  42.48 
 
 
187 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  43.11 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  42.41 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  40.54 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  40.54 
 
 
247 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  43.87 
 
 
223 aa  125  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  41.83 
 
 
178 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  41.67 
 
 
235 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  42.21 
 
 
208 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  41.61 
 
 
213 aa  119  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  42.36 
 
 
210 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  40.4 
 
 
167 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  41.94 
 
 
235 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  40.41 
 
 
267 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  41.13 
 
 
226 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  35.91 
 
 
220 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  36.11 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  35.81 
 
 
321 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  38.03 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  39.63 
 
 
202 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  36.55 
 
 
218 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  35.9 
 
 
156 aa  86.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  35.29 
 
 
222 aa  86.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  28.77 
 
 
144 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  29.7 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  27.67 
 
 
238 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  28.74 
 
 
194 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  26.52 
 
 
226 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  28.89 
 
 
375 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  29.68 
 
 
213 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  30.97 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  28.03 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  31.31 
 
 
384 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  33.01 
 
 
257 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  25.44 
 
 
235 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  32.04 
 
 
239 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>