62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3106 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 		 226 aa  424  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  42.02 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  55 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  48.94 
 
 		 267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  38 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  47.52 
 
 		 167 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  42.66 
 
 		 368 aa  118  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  45.81 
 
 		 188 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  40.3 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  39.33 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  47.55 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  37.89 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  44.76 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  46.27 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  41.67 
 
 		 291 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  48.61 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  46.3 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  39.73 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  39.31 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  35.93 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  39.41 
 
 		 178 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  42.55 
 
 		 156 aa  102  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  32.87 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  40.69 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  38.67 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  39.16 
 
 		 347 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  42.67 
 
 		 279 aa  99.4  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  36.77 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  44.06 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  40.14 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  37.76 
 
 		 309 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  41.33 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  36.6 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  35.42 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  38.36 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  41.13 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  39.61 
 
 		 216 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  41.5 
 
 		 946 aa  88.2  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  32.14 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  32.14 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  41.89 
 
 		 196 aa  85.1  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  38.51 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  39.86 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  37.91 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  36.31 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  43.59 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  34.01 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  34.09 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  40.34 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  40.16 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  30.66 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  33.79 
 
 		 384 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  32.97 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  32.82 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  30.05 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  31.82 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  38.06 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  29.49 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  31.13 
 
 		 288 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  31.72 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  37.08 
 
 		 350 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  34.19 
 
 		 298 aa  41.6  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>