50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3978 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
247 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  98.79 
 
 
247 aa  478  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  40.72 
 
 
214 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  37.1 
 
 
284 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  46.84 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  43.92 
 
 
368 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  38.7 
 
 
225 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  44.72 
 
 
235 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  45.14 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  44.59 
 
 
946 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  43.9 
 
 
188 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  39.87 
 
 
291 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  41.25 
 
 
242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  44.3 
 
 
245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  42.11 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  37.44 
 
 
223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  41.72 
 
 
203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  38.1 
 
 
276 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  40.88 
 
 
214 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  41.29 
 
 
178 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  41.83 
 
 
279 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  47.83 
 
 
196 aa  121  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  43.59 
 
 
309 aa  121  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  41.18 
 
 
279 aa  121  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  45.45 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  42.86 
 
 
192 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  41.01 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  39.34 
 
 
235 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  40 
 
 
213 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  40.33 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  39.87 
 
 
187 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  41.38 
 
 
210 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  39.46 
 
 
167 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  31.18 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  40.52 
 
 
202 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 
218 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  34.66 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  37.14 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  31.91 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  32.47 
 
 
156 aa  79  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  32.62 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  31.88 
 
 
222 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  33.86 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  27.67 
 
 
238 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  30.49 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  29.52 
 
 
194 aa  58.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  27.85 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  28.1 
 
 
213 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3869  peptidase C60 sortase A and B  25.69 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0637874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  38.38 
 
 
328 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>