50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09850 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  100 
 
 		 144 aa  293  5e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  36.55 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  36.55 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  35.48 
 
 		 368 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  33.79 
 
 		 245 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  32.88 
 
 		 178 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  38.71 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  38.71 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  36.81 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  31.54 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  36.29 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  32.41 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  35.2 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  32.79 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  34.43 
 
 		 347 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  30.56 
 
 		 284 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  32.79 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  31.72 
 
 		 276 aa  63.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  32.17 
 
 		 210 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  35.43 
 
 		 242 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  33.33 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  35.77 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  28.77 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  32.39 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  33.08 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  28.17 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  30.5 
 
 		 298 aa  57.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  32.67 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  31.01 
 
 		 946 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  33.59 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  30.77 
 
 		 241 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  33.87 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  31.58 
 
 		 235 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  32.56 
 
 		 226 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  29.84 
 
 		 235 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  32 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  29.37 
 
 		 267 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10380  hypothetical protein  33.06 
 
 		 282 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0366164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  27.78 
 
 		 216 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  40.96 
 
 		 328 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  29.37 
 
 		 226 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  30.61 
 
 		 213 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  31.82 
 
 		 375 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  27.7 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  30.71 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  27.34 
 
 		 251 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  33.07 
 
 		 194 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  30.23 
 
 		 384 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>