63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4117 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 		 210 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  55.86 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  54.48 
 
 		 245 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  50.34 
 
 		 276 aa  142  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  54.42 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  53.47 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  45.24 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  47.59 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  51.72 
 
 		 223 aa  134  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  50.34 
 
 		 214 aa  134  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  54.23 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  47.18 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  45.45 
 
 		 347 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  46.07 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  46.26 
 
 		 368 aa  124  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  44.37 
 
 		 284 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  48.94 
 
 		 298 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  48.25 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  42.36 
 
 		 291 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  47.5 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  47.62 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  40.37 
 
 		 187 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  44.9 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  48.65 
 
 		 946 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  40.7 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  46.81 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  49.32 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  45.52 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  43.45 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  45.52 
 
 		 279 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  45.21 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  40.71 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  40.71 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  42.36 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  36.24 
 
 		 321 aa  96.7  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  37.76 
 
 		 267 aa  95.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  38.33 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  41.04 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  39.02 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  35.62 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  41.45 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  34.27 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  34.69 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  38.03 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  37.93 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  33.1 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  40.94 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  32.17 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  36.17 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  35.17 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  35.16 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  32.84 
 
 		 384 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  33.58 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  32.82 
 
 		 375 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  31.43 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  32.3 
 
 		 350 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  27.39 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  31.29 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  28.37 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  32.28 
 
 		 354 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  38.78 
 
 		 288 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  27.81 
 
 		 235 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  32.12 
 
 		 298 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>