63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1145 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  58.66 
 
 
178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  45.39 
 
 
368 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  50.68 
 
 
284 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  49.3 
 
 
212 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  44.65 
 
 
245 aa  140  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  50.64 
 
 
242 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  47.22 
 
 
203 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  41.58 
 
 
188 aa  137  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  44 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  45.33 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  48.59 
 
 
192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  44.83 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  42.11 
 
 
291 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  43.36 
 
 
298 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  42.76 
 
 
235 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  39.62 
 
 
208 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  42.86 
 
 
279 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  46.75 
 
 
946 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  41.4 
 
 
279 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  40.38 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  41.8 
 
 
196 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  40.37 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  39.19 
 
 
347 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  41.96 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  44 
 
 
235 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  38.82 
 
 
213 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  40.56 
 
 
247 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  38.67 
 
 
309 aa  104  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  40.56 
 
 
247 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  37.93 
 
 
214 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  39.58 
 
 
276 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  36.43 
 
 
226 aa  99  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  36.13 
 
 
218 aa  95.5  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  36.25 
 
 
220 aa  93.2  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  37.84 
 
 
267 aa  87  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  36.13 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  33.12 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  36.43 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  33.77 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  35.76 
 
 
238 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  37.5 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  36.24 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  34.97 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  33.33 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  32.94 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  29.25 
 
 
228 aa  62.8  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  33.91 
 
 
213 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  34.74 
 
 
260 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  33.9 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  35.35 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  26.35 
 
 
302 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  26.99 
 
 
238 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  31.31 
 
 
301 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  28.28 
 
 
298 aa  45.1  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  26.67 
 
 
235 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  30.3 
 
 
288 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  30.95 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  31.43 
 
 
375 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  32.93 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  31.29 
 
 
384 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  28.8 
 
 
350 aa  41.2  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>