81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0663 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  58.33 
 
 		 203 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  50.81 
 
 		 202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  57.31 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  51.7 
 
 		 239 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  58.48 
 
 		 207 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  50 
 
 		 257 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  55.83 
 
 		 193 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  48.82 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  45.18 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  41.11 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  43.2 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  38.17 
 
 		 234 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  38.8 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  38.8 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  38.8 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  38.3 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  36.76 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  37.22 
 
 		 229 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  40.22 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  40.22 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.51 
 
 		 228 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  36.84 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  34.02 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  36.26 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  34.67 
 
 		 238 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  34.24 
 
 		 266 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  33 
 
 		 229 aa  100  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  30.27 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  35.64 
 
 		 206 aa  97.1  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  36.43 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  33.85 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  35.04 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  33.9 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  33.04 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  33.04 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  29.55 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  29.55 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0452  sortase family protein  30.27 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  30 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  30 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  30 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.23 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  30 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  26.72 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  32.14 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.46 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  30 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.63 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  29.46 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  33.57 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  32.63 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  32.41 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  33.62 
 
 		 263 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  33.9 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  32.85 
 
 		 308 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  32.21 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  30.6 
 
 		 320 aa  49.7  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  31.85 
 
 		 279 aa  48.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  40.45 
 
 		 269 aa  48.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  44.12 
 
 		 262 aa  48.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  31.03 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  34.96 
 
 		 323 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  31.11 
 
 		 279 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  32.74 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  27.91 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  29.86 
 
 		 377 aa  45.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.11 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  34.62 
 
 		 328 aa  45.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  26.16 
 
 		 291 aa  44.7  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  29.1 
 
 		 298 aa  44.7  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  42.53 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  32.2 
 
 		 339 aa  44.3  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  29.91 
 
 		 293 aa  43.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  30.58 
 
 		 238 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  21.09 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  22.96 
 
 		 312 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  27.97 
 
 		 316 aa  41.6  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  29.2 
 
 		 270 aa  41.6  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  26.79 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  30.97 
 
 		 381 aa  41.2  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>