76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2294 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  45.56 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  42.05 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  45.18 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  46.2 
 
 		 195 aa  147  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  44.68 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  45.56 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  45.71 
 
 		 257 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  46.43 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  42.25 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  42.25 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  42.25 
 
 		 234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  43.18 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  39.57 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  43.02 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  41.71 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  42.39 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  45.66 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  45.45 
 
 		 193 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  42.61 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  43.1 
 
 		 204 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  42.77 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  42.2 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  38.22 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  41.12 
 
 		 229 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  38.92 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  42.13 
 
 		 266 aa  121  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  38.24 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  39.56 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  30.6 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  32.26 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  35 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  34.92 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  33.06 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  33.33 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  30.95 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  30.95 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.8 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.13 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.13 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.33 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.13 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  34.13 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  30.16 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.54 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.33 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  41.67 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  30 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  29.74 
 
 		 556 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  32.61 
 
 		 323 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  32.54 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  34.17 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  31.5 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  31.2 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  30.26 
 
 		 521 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  29.41 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  36.9 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  30.4 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  29.45 
 
 		 328 aa  48.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  32.41 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  31.62 
 
 		 292 aa  46.2  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  27.46 
 
 		 268 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  29.27 
 
 		 320 aa  45.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  31.3 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  24.75 
 
 		 312 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  31.36 
 
 		 234 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  27.21 
 
 		 308 aa  45.1  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0452  sortase family protein  31.25 
 
 		 352 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  32.59 
 
 		 238 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  24.58 
 
 		 298 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0449  sortase family protein  34.18 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  27.67 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  32.8 
 
 		 269 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  25.5 
 
 		 298 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  25.5 
 
 		 302 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  37.33 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>