66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1394 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  100 
 
 
203 aa  391  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  81.68 
 
 
207 aa  315  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  83.17 
 
 
207 aa  293  9e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  71.52 
 
 
196 aa  225  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  70.83 
 
 
193 aa  215  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  58.33 
 
 
188 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  54.07 
 
 
202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  49.42 
 
 
239 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  47.67 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  45.45 
 
 
196 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  45.66 
 
 
199 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  41.62 
 
 
244 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  36.55 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  37.1 
 
 
234 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  37.1 
 
 
234 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  37.1 
 
 
232 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  36.56 
 
 
234 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  36.56 
 
 
213 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  43.1 
 
 
195 aa  121  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  40.1 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  36.46 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.95 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  36.42 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  37.88 
 
 
266 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  38.24 
 
 
197 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  34.97 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  33.18 
 
 
229 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  34.64 
 
 
206 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  30.82 
 
 
185 aa  97.8  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  35.39 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  33.61 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  29.75 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  25.4 
 
 
223 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0452  sortase family protein  33.84 
 
 
352 aa  58.2  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  29.23 
 
 
236 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  29.23 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  26.98 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  28.57 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.57 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.57 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.57 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.08 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  24.08 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  31.69 
 
 
265 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.65 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  28.1 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.48 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  25.4 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  32.8 
 
 
269 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.4 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  32.41 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  25.2 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  34.38 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  38.84 
 
 
323 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  32.56 
 
 
320 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  33.62 
 
 
291 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  25.75 
 
 
316 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  25.5 
 
 
312 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  30.33 
 
 
286 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  27.61 
 
 
521 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  28.12 
 
 
305 aa  41.6  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  50 
 
 
214 aa  41.6  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 
263 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  25.49 
 
 
236 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  29 
 
 
222 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  26.32 
 
 
293 aa  41.2  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>