63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5133 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 		 193 aa  362  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  66.18 
 
 		 203 aa  230  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  70.16 
 
 		 207 aa  228  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  69.23 
 
 		 196 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  70.16 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  52.72 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  50.85 
 
 		 202 aa  171  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  50.54 
 
 		 239 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  49.13 
 
 		 257 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  44.44 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  35.57 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  42.16 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  45.56 
 
 		 195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  36.82 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  35.94 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  40 
 
 		 244 aa  114  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  35.5 
 
 		 229 aa  111  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  34.9 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  34.9 
 
 		 232 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  35.94 
 
 		 234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  33.66 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  37.22 
 
 		 228 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  34.95 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  34.81 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  34.3 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  33.82 
 
 		 266 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  35.39 
 
 		 197 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  36 
 
 		 214 aa  91.7  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  33.33 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  28.57 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  33.04 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  35.48 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0452  sortase family protein  33.16 
 
 		 352 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  35.17 
 
 		 249 aa  52.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  30.43 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  27.42 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  33.52 
 
 		 323 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  33.33 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  31.78 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  22.51 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  22.51 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  36.17 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  43.37 
 
 		 235 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  47.62 
 
 		 262 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  25.86 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  26.67 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  30.51 
 
 		 265 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  35.66 
 
 		 234 aa  44.7  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  25 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  36.56 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  35.78 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  25.89 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.35 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.26 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  27.14 
 
 		 556 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  37.76 
 
 		 328 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  44.07 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  28.47 
 
 		 521 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.03 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.03 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  27.03 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.03 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  26.13 
 
 		 206 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>