88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1626 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  100 
 
 		 208 aa  433  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  53.3 
 
 		 234 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  52.79 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  53.54 
 
 		 229 aa  218  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  53.37 
 
 		 234 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  54.97 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  52.06 
 
 		 234 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  55.43 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  56.5 
 
 		 204 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  57.06 
 
 		 228 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  55 
 
 		 197 aa  207  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  50.26 
 
 		 266 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  50.26 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  51.89 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  47.22 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  41.75 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  39.36 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  40.74 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  38.3 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  38.22 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  35.48 
 
 		 202 aa  121  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  37.37 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  40.1 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  37.04 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  40.56 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  36.52 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  37.71 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  32.09 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  38.89 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  30.89 
 
 		 185 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  39.66 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  32.81 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  33.9 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  32 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  34.75 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  38.71 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  33.93 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  35.45 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  35.45 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  33.9 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  36.52 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  33.33 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.71 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.71 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.71 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  34.55 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.55 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  33.63 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  32.28 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  31.5 
 
 		 556 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.64 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  31.97 
 
 		 312 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  36.63 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  34.23 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  29.52 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2603  sortase  26 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2551  sortase  26 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  35.64 
 
 		 298 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  27.5 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  36.25 
 
 		 302 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  27.5 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  31.4 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  39.33 
 
 		 354 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  33.02 
 
 		 323 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  34.55 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  38.71 
 
 		 350 aa  48.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  28.69 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2089  sortase  25.12 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  29.2 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.32 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  33.68 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  32.08 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  33.68 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  26.07 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  31.19 
 
 		 305 aa  46.2  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  36.36 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  35.8 
 
 		 298 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  24.87 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  28.69 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  30.83 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  33 
 
 		 167 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  32.53 
 
 		 276 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  33.96 
 
 		 218 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  30.84 
 
 		 384 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  28.83 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  26.56 
 
 		 250 aa  41.6  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>