114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0134 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  100 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  58.59 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  41.41 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  44.59 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  45.15 
 
 		 238 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  40.77 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  41.28 
 
 		 556 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  43.32 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  40.66 
 
 		 353 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  42.01 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  41.63 
 
 		 521 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  37.77 
 
 		 192 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  34.98 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  36.49 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  40.09 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  40.48 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  37.44 
 
 		 412 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  36.36 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  38.13 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  36.36 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  40.1 
 
 		 312 aa  134  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  33.67 
 
 		 368 aa  120  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  35.27 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  37.5 
 
 		 243 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  34.95 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  38.46 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  43.66 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  33.64 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  27.62 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  30.5 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  34.65 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  25.67 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  26.86 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  25.98 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  25.13 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  24.71 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  34.68 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  35.29 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  34.75 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  31.67 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  34.07 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  34.91 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  23.56 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  35.78 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  33.08 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  35.14 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  38.1 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  34.21 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  31.45 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  29.75 
 
 		 377 aa  55.1  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  26.71 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  27.01 
 
 		 327 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  33.96 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  32.31 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  26.14 
 
 		 272 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  35.35 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  33.06 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  25.69 
 
 		 286 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  34.33 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  27.16 
 
 		 268 aa  51.6  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  30.77 
 
 		 324 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  30.66 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.7 
 
 		 336 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  25.57 
 
 		 272 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.36 
 
 		 307 aa  49.7  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0449  sortase family protein  39.08 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  24.6 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  27.41 
 
 		 260 aa  48.5  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.2 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  27.68 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  36.79 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  26.28 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  31.68 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  25.56 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  30.09 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  30.19 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  30.19 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  30 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  30 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  24.05 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  32.97 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  25.87 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  28.36 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  25 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  22.54 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  30.19 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  29.46 
 
 		 279 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  25.55 
 
 		 293 aa  45.4  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  31.25 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  32.37 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  34.29 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  26.89 
 
 		 377 aa  45.4  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  26.23 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  39.39 
 
 		 301 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  33.56 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  35.24 
 
 		 308 aa  45.1  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  23.71 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  28.93 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  29.25 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>