56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1682 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
316 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  41.7 
 
 
238 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  38.36 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  39.91 
 
 
276 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.72 
 
 
257 aa  129  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  37.83 
 
 
323 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  36.18 
 
 
249 aa  119  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  38.57 
 
 
234 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  34.84 
 
 
268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  32.94 
 
 
266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  32.51 
 
 
242 aa  112  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  37.13 
 
 
270 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  34.95 
 
 
218 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  30.11 
 
 
312 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  33.19 
 
 
412 aa  102  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  31.06 
 
 
260 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  30.64 
 
 
238 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  31.69 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  40.15 
 
 
243 aa  90.1  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  32 
 
 
368 aa  87.4  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  29.48 
 
 
556 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  33.85 
 
 
192 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  31.76 
 
 
521 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  30.84 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  32.58 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  33.78 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  28.98 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  30.45 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  27.31 
 
 
262 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  28.57 
 
 
200 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  26.52 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  23.24 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  33.33 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  28.48 
 
 
220 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  23.5 
 
 
187 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  29.94 
 
 
267 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  32.37 
 
 
263 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  29.63 
 
 
328 aa  49.3  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  27.88 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  29.37 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  32.1 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  31.65 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1118  peptidase C60, sortase A and B  27.89 
 
 
263 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  25.68 
 
 
215 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  29.53 
 
 
218 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  26.2 
 
 
222 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  29.75 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  25.78 
 
 
217 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.48 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  28.48 
 
 
195 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  27.21 
 
 
207 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  33.79 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  29.63 
 
 
292 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  23.85 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  27.14 
 
 
327 aa  42.7  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  30 
 
 
269 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>