58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2421 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 		 216 aa  438  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  49.77 
 
 		 218 aa  194  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  62.94 
 
 		 195 aa  191  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  60.93 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  63.12 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  54.61 
 
 		 267 aa  167  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1118  peptidase C60, sortase A and B  50 
 
 		 263 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  42.41 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  43.38 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  34.62 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  35.59 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  30.88 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  33.65 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  33.33 
 
 		 384 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  38.61 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  32.31 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  28.75 
 
 		 377 aa  52.4  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  29.41 
 
 		 269 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.06 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  28.46 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  31.51 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  29.61 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  29.25 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  34.86 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  33.86 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  35.24 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  29.86 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  34.68 
 
 		 323 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.33 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  30.67 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  33.86 
 
 		 249 aa  48.9  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  30.25 
 
 		 293 aa  48.9  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  30.67 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.67 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.67 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.67 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.67 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  30.08 
 
 		 327 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.67 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.33 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  33.33 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  29.63 
 
 		 365 aa  47.8  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  31.11 
 
 		 292 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  25.2 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  29.33 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  29.33 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  30 
 
 		 291 aa  45.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  29.36 
 
 		 336 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  26.67 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  28.36 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  23.03 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  31.51 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  31.45 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  28 
 
 		 395 aa  43.5  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  29.93 
 
 		 324 aa  42.4  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  24.04 
 
 		 312 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  27.44 
 
 		 316 aa  41.6  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  34.43 
 
 		 236 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>