106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05680 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  100 
 
 
336 aa  699    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  51.77 
 
 
279 aa  261  8e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  45.42 
 
 
270 aa  220  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  39.53 
 
 
327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  46.61 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  41.11 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  41.06 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  42.26 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  41.85 
 
 
286 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  41.18 
 
 
268 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  44 
 
 
307 aa  190  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  36.04 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  38.77 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  40.46 
 
 
282 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  37.08 
 
 
291 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  40.46 
 
 
267 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  36.24 
 
 
324 aa  181  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  41.74 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  36.91 
 
 
377 aa  175  8e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  39.74 
 
 
316 aa  168  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  40.28 
 
 
273 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  42.11 
 
 
273 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  37.34 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  38.25 
 
 
260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  37.13 
 
 
344 aa  163  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  37.89 
 
 
305 aa  162  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  37.68 
 
 
339 aa  155  8e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  36.64 
 
 
381 aa  153  5e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  37.39 
 
 
377 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  34.93 
 
 
337 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  32.97 
 
 
265 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  33.09 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  36.44 
 
 
384 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  52.67 
 
 
249 aa  144  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  33.7 
 
 
395 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  34.58 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  33.2 
 
 
292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  47.32 
 
 
189 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  29.03 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.23 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.23 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.76 
 
 
210 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.76 
 
 
210 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  26.29 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  26.29 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.29 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.29 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.29 
 
 
233 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  24.77 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  24.88 
 
 
210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  23.68 
 
 
247 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  30.95 
 
 
187 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  31.01 
 
 
225 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  29.93 
 
 
200 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  30.95 
 
 
187 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  32.17 
 
 
268 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  25.82 
 
 
262 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  22.97 
 
 
222 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  30.23 
 
 
220 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  30.89 
 
 
197 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.31 
 
 
206 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  31.3 
 
 
270 aa  56.2  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  31.3 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  33.04 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.31 
 
 
206 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  25.76 
 
 
209 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.46 
 
 
206 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.23 
 
 
206 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.46 
 
 
206 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.46 
 
 
198 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  28.48 
 
 
249 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.46 
 
 
206 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  29.46 
 
 
206 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  28.68 
 
 
206 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  33.93 
 
 
238 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  31.91 
 
 
521 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  26.87 
 
 
223 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  25.71 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  25.88 
 
 
206 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  29.84 
 
 
192 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  29.11 
 
 
205 aa  50.1  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  27.4 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  25.9 
 
 
229 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  30.7 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  26.09 
 
 
243 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  36.67 
 
 
350 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2551  sortase  29.37 
 
 
206 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2603  sortase  29.37 
 
 
206 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  28 
 
 
238 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  30.91 
 
 
235 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  29.63 
 
 
268 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  26.15 
 
 
244 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  24.66 
 
 
238 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  31.72 
 
 
262 aa  46.2  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  30.7 
 
 
195 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  21.86 
 
 
236 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  26.47 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  29.08 
 
 
556 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  29.6 
 
 
216 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  30.08 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>