134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2138 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  100 
 
 		 323 aa  629  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  48 
 
 		 249 aa  205  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  49.47 
 
 		 192 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  45.85 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  43.78 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  43.89 
 
 		 218 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  41.13 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  42.04 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  41.18 
 
 		 556 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  43.38 
 
 		 521 aa  165  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  40 
 
 		 268 aa  159  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  40.38 
 
 		 229 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  41.63 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  35.34 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  35.69 
 
 		 257 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  36.16 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  38.01 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  34.65 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  38.34 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  34.03 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  37.16 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  41.38 
 
 		 243 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  37.83 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  33.48 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  36.24 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  35.53 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  36.89 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  42.59 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  33.19 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  26.69 
 
 		 225 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  27.16 
 
 		 220 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  32.08 
 
 		 200 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  37.2 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  32.61 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  32.61 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  36.88 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  30.19 
 
 		 197 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  36.14 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  33.33 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  37.5 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  37.9 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  35.34 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  26.42 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  35.54 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  35.04 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  30.82 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  35.92 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  31.5 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  30.14 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  31.89 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.18 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  25 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  29.92 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  25 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  25 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  25.65 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  34.59 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  26.7 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  38.46 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.33 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  29.92 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.99 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  35.07 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  25 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  30.94 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  28.74 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  25.97 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  35.14 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.2 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  27.53 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.6 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  22.89 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  22.89 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.04 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  28.57 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  39.23 
 
 		 196 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  30 
 
 		 377 aa  55.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  25.62 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  25.79 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0449  sortase family protein  40.48 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  27.33 
 
 		 260 aa  53.9  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  32.61 
 
 		 199 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  32.26 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  25.95 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  25.62 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  31.19 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  29.45 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  30.83 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  33.52 
 
 		 193 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  36.94 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  31.82 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  29.93 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  31.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  29.08 
 
 		 202 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  28.47 
 
 		 292 aa  49.7  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  23.6 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  34.68 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  33.02 
 
 		 208 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  29.03 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  25.95 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>