64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0017 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  74.44 
 
 
260 aa  370  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  44.13 
 
 
268 aa  202  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  44.12 
 
 
276 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  44.36 
 
 
270 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  40.17 
 
 
238 aa  175  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  38.67 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  39.41 
 
 
412 aa  171  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  37.93 
 
 
368 aa  169  6e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  39.27 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  38.56 
 
 
249 aa  151  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  38.84 
 
 
238 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  37.39 
 
 
242 aa  149  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  36.71 
 
 
556 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  33.76 
 
 
323 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  34.98 
 
 
218 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  36.02 
 
 
521 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  34.65 
 
 
229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  35.89 
 
 
243 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  34.48 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  30.69 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  40.43 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  34.31 
 
 
316 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  31.6 
 
 
192 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  33.09 
 
 
353 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  30.12 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  28.74 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  31.3 
 
 
286 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  33.33 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  25.93 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  32.86 
 
 
187 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  32.14 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  25.23 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  34.09 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  25.88 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  26.23 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  33.33 
 
 
298 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  29.5 
 
 
197 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  37.01 
 
 
205 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  26.67 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  27.03 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  26.37 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  30.83 
 
 
327 aa  51.6  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  26.37 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  27.67 
 
 
350 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  38.81 
 
 
288 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  29.79 
 
 
262 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  32.26 
 
 
209 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  21.72 
 
 
293 aa  49.3  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  32.63 
 
 
214 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  24.31 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  27.74 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  33.72 
 
 
328 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  27.74 
 
 
269 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  31.13 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  27.69 
 
 
301 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  24.76 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  23.94 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  21.43 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  27.94 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  28.83 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  29.13 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  26.45 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  24.56 
 
 
210 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>