51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2959 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  83.67 
 
 		 302 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  52.34 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  47.84 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5062  sortase family protein  33.88 
 
 		 241 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000275463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  37.16 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  39.84 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  39.19 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  38.06 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  36 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  33.76 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  35.16 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  31.21 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  31.9 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  31.01 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  31.52 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  31.03 
 
 		 220 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  30.88 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  30.82 
 
 		 375 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  32.26 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.32 
 
 		 243 aa  52.8  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  29.7 
 
 		 298 aa  52.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  28.99 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  34.62 
 
 		 208 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  29.11 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  27.93 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  30.2 
 
 		 197 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  39.8 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  25 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  35 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  32 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  32.73 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  28.42 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  35.64 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  30.15 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  31.82 
 
 		 265 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  31.87 
 
 		 192 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  32.32 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  30.43 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  30.91 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  43.14 
 
 		 218 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  30 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  27.75 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  30.37 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  28 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  29.03 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  30.11 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  28.09 
 
 		 223 aa  42.7  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.46 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  23.5 
 
 		 222 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  29 
 
 		 238 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>