67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0029 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  100 
 
 
368 aa  759    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  59.37 
 
 
412 aa  421  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  36.51 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  38.98 
 
 
270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  36.64 
 
 
266 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  34.85 
 
 
276 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  37.78 
 
 
260 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  35.2 
 
 
257 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  36.75 
 
 
249 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  36.16 
 
 
323 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  41.44 
 
 
243 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  33.76 
 
 
238 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  34.06 
 
 
242 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  47.45 
 
 
192 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  43.75 
 
 
251 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  37.44 
 
 
229 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  34.51 
 
 
234 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  34.22 
 
 
238 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  37.1 
 
 
556 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  33.67 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  36.04 
 
 
312 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  35.62 
 
 
521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  38.38 
 
 
353 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  26.97 
 
 
298 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  32.1 
 
 
262 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  33.68 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  32 
 
 
316 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  27.12 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  34.09 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  26.38 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  28.96 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  31.4 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  30.58 
 
 
187 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  29.81 
 
 
197 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  32.79 
 
 
209 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  26.67 
 
 
200 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  30.77 
 
 
262 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  27.14 
 
 
210 aa  53.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  30.47 
 
 
298 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.86 
 
 
210 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.68 
 
 
233 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  30.68 
 
 
210 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.68 
 
 
210 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  32 
 
 
250 aa  50.4  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  30.68 
 
 
210 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.68 
 
 
210 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.68 
 
 
210 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.68 
 
 
210 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.68 
 
 
210 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.37 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  30.23 
 
 
222 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  28.52 
 
 
238 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  30.89 
 
 
272 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  26.29 
 
 
206 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  30.58 
 
 
272 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  28.17 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  26.95 
 
 
268 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  30 
 
 
235 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  29.41 
 
 
265 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  32.58 
 
 
247 aa  45.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  30.25 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  30.53 
 
 
377 aa  43.9  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  29.66 
 
 
205 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  29.73 
 
 
328 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  29.07 
 
 
210 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  33.7 
 
 
269 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  24.24 
 
 
286 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>