56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03380 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  54.89 
 
 
242 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  47.84 
 
 
276 aa  211  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  43.37 
 
 
268 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  38.31 
 
 
266 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  41.13 
 
 
412 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  40.71 
 
 
260 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  39.75 
 
 
270 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  35.2 
 
 
368 aa  155  4e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  36.55 
 
 
323 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  40.39 
 
 
243 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  36.55 
 
 
238 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  36.54 
 
 
229 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  35.71 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  34.75 
 
 
238 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  33.61 
 
 
249 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  33.9 
 
 
316 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  37.84 
 
 
234 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  35.65 
 
 
556 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  34.33 
 
 
521 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  32.52 
 
 
192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 
262 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  39.08 
 
 
251 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  38.46 
 
 
218 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  30.87 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  28.57 
 
 
298 aa  86.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  31.78 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  28.15 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  35.71 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  34.92 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  31.43 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  30 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  30 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  29.74 
 
 
197 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  31.12 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  29.57 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  33.59 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  31.65 
 
 
200 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  35.96 
 
 
298 aa  52.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  32.88 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  28.65 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  26.94 
 
 
262 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  25.15 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  31.06 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  33.71 
 
 
302 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  32.17 
 
 
324 aa  47.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  32.56 
 
 
302 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  24.32 
 
 
206 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  26.5 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  24.86 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  30.08 
 
 
327 aa  42.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  31.46 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  30 
 
 
208 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  26.53 
 
 
229 aa  42.4  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  23.76 
 
 
244 aa  42  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  26.15 
 
 
223 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>