43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0919 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 		 328 aa  630  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0449  sortase family protein  46.51 
 
 		 216 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  37.5 
 
 		 263 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  50 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  37.2 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  38.16 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  38.02 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  43.18 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  43.81 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  34.53 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  41.38 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  40.45 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  28.82 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  28.33 
 
 		 187 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  31.21 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  35.79 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  28.33 
 
 		 187 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  42.65 
 
 		 262 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  28.43 
 
 		 220 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  37.37 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  34.86 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.65 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  31.16 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  29.44 
 
 		 260 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  27.45 
 
 		 225 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  33.67 
 
 		 197 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  33.7 
 
 		 276 aa  49.3  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  30 
 
 		 556 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  35.71 
 
 		 199 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  32.14 
 
 		 521 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  33.72 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  33.04 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  29.58 
 
 		 316 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  30.63 
 
 		 222 aa  46.2  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  36.78 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  34.88 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  40.96 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  34.62 
 
 		 188 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  37.5 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  43.18 
 
 		 196 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  29.73 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  32.33 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  32.05 
 
 		 202 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>