138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0212 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  100 
 
 
187 aa  371  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  98.93 
 
 
187 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  41.84 
 
 
220 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  41.84 
 
 
225 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.69 
 
 
270 aa  88.2  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  33.56 
 
 
229 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  34.27 
 
 
249 aa  87  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  33.57 
 
 
238 aa  84.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  32.17 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  29.1 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  35.57 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  38.02 
 
 
243 aa  82  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  26.9 
 
 
234 aa  81.3  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  30.2 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  28.1 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  28.17 
 
 
268 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  27.23 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  30.49 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  30 
 
 
282 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  25.67 
 
 
218 aa  77.8  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  30 
 
 
267 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  30.56 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  31.29 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.71 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  27.62 
 
 
272 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  28.57 
 
 
272 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  31.54 
 
 
266 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  29.93 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  31.34 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  35.2 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  28.57 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  29.81 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  31.62 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  30.88 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  28.75 
 
 
368 aa  71.2  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  33.09 
 
 
260 aa  71.2  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  37.39 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  33.33 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  31.13 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.43 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  32.17 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  31.16 
 
 
292 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  24.86 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  28.44 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  29.58 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  29.01 
 
 
327 aa  65.5  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  28.99 
 
 
298 aa  65.1  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  30.56 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  29.66 
 
 
294 aa  64.7  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  27.34 
 
 
263 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  29.55 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  32.8 
 
 
288 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  26.47 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.26 
 
 
336 aa  63.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  31.43 
 
 
302 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  28.48 
 
 
305 aa  62  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  31.36 
 
 
279 aa  62  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  26.44 
 
 
229 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  29.92 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  28.85 
 
 
324 aa  62  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  30.97 
 
 
293 aa  61.2  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.74 
 
 
307 aa  61.2  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  27.59 
 
 
291 aa  61.2  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.43 
 
 
206 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  31.39 
 
 
521 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  31.39 
 
 
556 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  32.73 
 
 
353 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.37 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.29 
 
 
198 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  28.68 
 
 
286 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  28.79 
 
 
381 aa  60.1  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0449  sortase family protein  27.97 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.37 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  26.37 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.29 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.29 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  29.41 
 
 
223 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  26.34 
 
 
257 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  30.58 
 
 
377 aa  58.2  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  27.41 
 
 
377 aa  58.2  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  25 
 
 
350 aa  57.8  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  28.99 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  27.81 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  23.67 
 
 
291 aa  57.4  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  25.27 
 
 
239 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  27.4 
 
 
337 aa  57.4  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  29.41 
 
 
233 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  23.24 
 
 
316 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  29.01 
 
 
339 aa  55.8  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  28.24 
 
 
365 aa  55.8  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.63 
 
 
206 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  28.26 
 
 
233 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  27.35 
 
 
249 aa  55.1  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  26.55 
 
 
316 aa  55.1  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  22.89 
 
 
262 aa  54.7  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  27.64 
 
 
328 aa  54.7  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  28.46 
 
 
301 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  27.23 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  29.66 
 
 
238 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  27.69 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>