63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5162 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  100 
 
 
196 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  67.55 
 
 
203 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  64.62 
 
 
207 aa  224  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  70.73 
 
 
193 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  65.13 
 
 
207 aa  201  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  47.47 
 
 
202 aa  180  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  50.85 
 
 
239 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  48.3 
 
 
188 aa  167  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  48.88 
 
 
257 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  43.37 
 
 
199 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  44.97 
 
 
196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  43.1 
 
 
244 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  45.56 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  36.51 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  36.36 
 
 
208 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  33.33 
 
 
229 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  37.16 
 
 
266 aa  119  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  34.59 
 
 
213 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  34.03 
 
 
234 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  33.16 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  34.03 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  34.03 
 
 
234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  33.72 
 
 
204 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  34.59 
 
 
229 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  35.5 
 
 
238 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  38.07 
 
 
214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.5 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  35.09 
 
 
197 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  34.25 
 
 
206 aa  104  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  27.44 
 
 
185 aa  91.3  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  34.51 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.55 
 
 
206 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  27.41 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.41 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.41 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  39.23 
 
 
323 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.46 
 
 
198 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  26.72 
 
 
223 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  32.31 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  27.41 
 
 
206 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.67 
 
 
206 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.41 
 
 
206 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.79 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  25.55 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  27.19 
 
 
197 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  25.38 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  25.19 
 
 
233 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  28.97 
 
 
209 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  37.17 
 
 
320 aa  48.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  38.94 
 
 
263 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  25.38 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  25.2 
 
 
200 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0452  sortase family protein  30.73 
 
 
352 aa  47  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  25.58 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  34.62 
 
 
234 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  31.78 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  43.18 
 
 
328 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  48.21 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  32.5 
 
 
339 aa  44.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  48.21 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  32.73 
 
 
321 aa  41.6  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  28.57 
 
 
293 aa  41.6  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  33.33 
 
 
260 aa  41.2  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>