58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2515 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  100 
 
 
229 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  53.54 
 
 
208 aa  218  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  56.35 
 
 
213 aa  218  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  59.28 
 
 
206 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  56.77 
 
 
229 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  52.71 
 
 
234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  52.22 
 
 
234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  52.22 
 
 
232 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  58.47 
 
 
197 aa  210  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  58.06 
 
 
204 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  51.71 
 
 
201 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  51.5 
 
 
234 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  56.76 
 
 
228 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  53.65 
 
 
266 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  44.83 
 
 
214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  41.01 
 
 
238 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  36.71 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  37.56 
 
 
196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  41.12 
 
 
199 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  35.71 
 
 
202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  36.36 
 
 
195 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  34.21 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  34.36 
 
 
207 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  33.18 
 
 
203 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  35.38 
 
 
239 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  34.03 
 
 
257 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  33 
 
 
188 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  34.41 
 
 
193 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  33.16 
 
 
207 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  28.89 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  38.18 
 
 
269 aa  59.3  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  34.78 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  35.29 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.66 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  30.36 
 
 
233 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  28.37 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  35.29 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  31.25 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  27.66 
 
 
206 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.12 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.12 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.12 
 
 
198 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  30.36 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  30.36 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.91 
 
 
206 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  26.57 
 
 
206 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  27.12 
 
 
209 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  32.35 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  35.56 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  28.05 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  34.04 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  34.04 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  28.57 
 
 
249 aa  42.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  32.08 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  32.97 
 
 
302 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  30.1 
 
 
521 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  36 
 
 
217 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  33.33 
 
 
350 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>