77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1674 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  100 
 
 
207 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  94.69 
 
 
207 aa  378  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  83.17 
 
 
203 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  71.69 
 
 
193 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  68.02 
 
 
196 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  58.48 
 
 
188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  51.34 
 
 
202 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  49.71 
 
 
239 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  47.95 
 
 
257 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  44.77 
 
 
196 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  42.61 
 
 
199 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  39.88 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  44.07 
 
 
195 aa  130  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  36.22 
 
 
234 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  36.26 
 
 
234 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  36.26 
 
 
234 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  36.26 
 
 
232 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  35.91 
 
 
229 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  35.71 
 
 
213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  34.27 
 
 
238 aa  117  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  38.89 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  36.02 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.37 
 
 
228 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  37.43 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  35.26 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  36.26 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  33.16 
 
 
229 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  37.43 
 
 
214 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  35 
 
 
206 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  30.38 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  32.8 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  31.2 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  31.71 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  27.91 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  30.83 
 
 
233 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  28.68 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  30.83 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.67 
 
 
206 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.67 
 
 
198 aa  61.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.67 
 
 
206 aa  61.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.48 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  32.86 
 
 
521 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  25 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  26.67 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  26.36 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.68 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  36.32 
 
 
323 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.39 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  26.24 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  32.14 
 
 
556 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  36.42 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.36 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  33.88 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  35.88 
 
 
320 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0452  sortase family protein  38.94 
 
 
352 aa  53.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  31.2 
 
 
269 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  32 
 
 
265 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  28.03 
 
 
312 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  31.76 
 
 
263 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  31.11 
 
 
236 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  30.47 
 
 
293 aa  48.5  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  34.25 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  28.91 
 
 
316 aa  46.2  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  25.38 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  25.38 
 
 
187 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  35.34 
 
 
291 aa  44.7  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  31.34 
 
 
308 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  33.6 
 
 
339 aa  44.3  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  33.33 
 
 
305 aa  42.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  33.78 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  41.43 
 
 
262 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  29.51 
 
 
286 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  28.45 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  39.53 
 
 
286 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.47 
 
 
270 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  32.74 
 
 
268 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  31.2 
 
 
365 aa  41.2  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>