79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2999 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  100 
 
 
257 aa  520  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  90.34 
 
 
239 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  50 
 
 
188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  45.23 
 
 
202 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  47.67 
 
 
203 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  51.22 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  47.95 
 
 
207 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  49.08 
 
 
193 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  47.95 
 
 
207 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  44.07 
 
 
196 aa  148  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  45.71 
 
 
199 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  40.54 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  37.04 
 
 
208 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  33.17 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  33.33 
 
 
234 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  33.33 
 
 
232 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  32.84 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  35.12 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  37.24 
 
 
238 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  35.18 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  38.18 
 
 
195 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  34.03 
 
 
229 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  35.32 
 
 
201 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  36 
 
 
214 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  32.47 
 
 
197 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.92 
 
 
228 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  36.22 
 
 
206 aa  99.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  33.68 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  33.33 
 
 
204 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  28.82 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.06 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  29.84 
 
 
197 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  34.13 
 
 
206 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  31.5 
 
 
233 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.13 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.54 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  33.33 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  31.5 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.54 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.33 
 
 
206 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.33 
 
 
206 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.33 
 
 
198 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  31.5 
 
 
233 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  29.13 
 
 
206 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  30.33 
 
 
223 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  31.67 
 
 
205 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  26.92 
 
 
187 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  26.92 
 
 
187 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0452  sortase family protein  31.02 
 
 
352 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  30 
 
 
222 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  28.46 
 
 
200 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  34.71 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  30.87 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  30.83 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  29.27 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  43.64 
 
 
203 aa  48.9  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  32.17 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  24.81 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  24.81 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  43.64 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  36.59 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  43.4 
 
 
167 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0449  sortase family protein  37.68 
 
 
216 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  27.64 
 
 
265 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  27.61 
 
 
236 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  30.16 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  27.64 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  23.67 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  31.78 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  27.27 
 
 
218 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2235  hypothetical protein  39.44 
 
 
98 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0496115  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  36.84 
 
 
298 aa  42.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  28.67 
 
 
192 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  36.84 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  36.84 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  30.23 
 
 
323 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  21.92 
 
 
312 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  27.69 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>