66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1734 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 		 214 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  84.74 
 
 		 203 aa  309  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  49.25 
 
 		 279 aa  168  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  46.67 
 
 		 279 aa  168  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  57.14 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  49.66 
 
 		 368 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  48.72 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  43.75 
 
 		 284 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  47.68 
 
 		 208 aa  141  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  42.36 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  51.02 
 
 		 946 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  51.05 
 
 		 298 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  55.24 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  48.61 
 
 		 188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  52.11 
 
 		 167 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  48.08 
 
 		 223 aa  134  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  48.3 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  44.64 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  44 
 
 		 187 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  48.39 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  46.58 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  45.95 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  49.3 
 
 		 347 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  41.38 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  43.24 
 
 		 276 aa  117  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  48.73 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  41.26 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  41.26 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  45.64 
 
 		 309 aa  114  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  46.15 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  44.72 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  45.21 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  40.88 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  47.89 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  44.6 
 
 		 267 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  34.25 
 
 		 321 aa  95.1  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  39.51 
 
 		 156 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  37.93 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  34.97 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  37.24 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  38.03 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  35.1 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  38.71 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  37.12 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  32.68 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  34.21 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  39.52 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  37.4 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  32.9 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  31.43 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  32.21 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  31.97 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  33.56 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  29.63 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  30.25 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  43.64 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  43.64 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  32.45 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 		 375 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  48.21 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5062  sortase family protein  31.85 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000275463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  31.58 
 
 		 384 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  31.25 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  44.07 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  32.35 
 
 		 243 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  50 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>