56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0452 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0452  sortase family protein  100 
 
 		 352 aa  687    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  34.62 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  32.06 
 
 		 200 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  34.27 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  30.27 
 
 		 188 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  34 
 
 		 207 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  33.84 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  30.83 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  31.58 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  31.02 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  29.05 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  36.69 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  30.16 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  28.12 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  28.91 
 
 		 233 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  38.18 
 
 		 196 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  29.49 
 
 		 244 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  33.03 
 
 		 238 aa  53.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  32.85 
 
 		 238 aa  53.1  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  31.25 
 
 		 199 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  30.83 
 
 		 202 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  31.13 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  36.36 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  23.08 
 
 		 206 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  32.5 
 
 		 192 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  35.9 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  28.57 
 
 		 236 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.38 
 
 		 206 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  30.65 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  32.54 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.03 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  33.91 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  31.82 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  25 
 
 		 223 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  27.91 
 
 		 273 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.02 
 
 		 206 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  37.82 
 
 		 263 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  24.03 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  32.61 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  37.04 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.02 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  27.13 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  32.5 
 
 		 556 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  36.23 
 
 		 521 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0449  sortase family protein  37.8 
 
 		 216 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  22.22 
 
 		 198 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  22.22 
 
 		 206 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  22.22 
 
 		 206 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  22.22 
 
 		 206 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  27.97 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  27.97 
 
 		 267 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  33.33 
 
 		 249 aa  43.5  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  29.66 
 
 		 270 aa  43.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  38.55 
 
 		 286 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  24.06 
 
 		 187 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  24.06 
 
 		 187 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>