48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3380 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  33.52 
 
 		 244 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  33.51 
 
 		 266 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  34.22 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  32.72 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  34.1 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  34.1 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  30.89 
 
 		 208 aa  101  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  31.77 
 
 		 213 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.58 
 
 		 228 aa  101  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  34.1 
 
 		 234 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  34.1 
 
 		 234 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  34.39 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  33.52 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  35.22 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  30.27 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  31.01 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  35.29 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  31.95 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  30.82 
 
 		 203 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  28.57 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  28.89 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  32.74 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  31.25 
 
 		 238 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  30.38 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  26.92 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  30.6 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  27.97 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  28.82 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  28.82 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  31.34 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  30.88 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.89 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  30.88 
 
 		 233 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  30.15 
 
 		 236 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.15 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  28.89 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.15 
 
 		 206 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.15 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.15 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.15 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  28.15 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.41 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  27.21 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  27.61 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  29.35 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  25 
 
 		 206 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  29.05 
 
 		 556 aa  41.2  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>