53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1794 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  100 
 
 		 266 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  54.41 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  53.37 
 
 		 213 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  53.85 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  53.85 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  53.85 
 
 		 234 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  53.3 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  53.65 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  57.22 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  56.59 
 
 		 228 aa  198  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  50.26 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  56.98 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  54.84 
 
 		 206 aa  195  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  51.55 
 
 		 201 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  48.5 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  41.63 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  35.82 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  34.83 
 
 		 196 aa  123  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  42.13 
 
 		 199 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  38.54 
 
 		 195 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  37.88 
 
 		 203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  37.65 
 
 		 196 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  35.71 
 
 		 207 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  33.51 
 
 		 185 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  35.67 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  34.24 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  34.09 
 
 		 193 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  33.68 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  35.16 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  35.4 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  38.1 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  30.18 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  32.2 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  36.9 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  30.36 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  29.46 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  30.36 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  30.36 
 
 		 236 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.76 
 
 		 206 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.09 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.76 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  31.48 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  30.59 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.59 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.59 
 
 		 198 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.59 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.59 
 
 		 206 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  29.41 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  30.11 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3324  band 7 protein  30.38 
 
 		 607 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  29.63 
 
 		 521 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  31.71 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  29.79 
 
 		 321 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>