56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2491 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  58.33 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  58.33 
 
 		 234 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  57.07 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  57.92 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  55.78 
 
 		 201 aa  228  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  57 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  60.11 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  58 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  61.71 
 
 		 204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  61.02 
 
 		 197 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  59.44 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  53.54 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  51.78 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  48.62 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  43.19 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  37.89 
 
 		 244 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  38.74 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  34.18 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  36.73 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  34.25 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  31.07 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  33.69 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  34.69 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  35.38 
 
 		 257 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  35.18 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  32.6 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  33.17 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  34.13 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  33.71 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  33.9 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  37.7 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  30.25 
 
 		 233 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  26.14 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  30.25 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  30.25 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.33 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  31.18 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.9 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.87 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  35.06 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  25.57 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  35.14 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  30 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  30 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  30 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  30 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  30.69 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  33.33 
 
 		 249 aa  45.4  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  28.02 
 
 		 521 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.11 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  29.29 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  29.33 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  30.49 
 
 		 312 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  28.92 
 
 		 556 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  35.9 
 
 		 192 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>