112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1161 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  100 
 
 		 377 aa  775    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  47.6 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  42.86 
 
 		 377 aa  179  9e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  38.43 
 
 		 307 aa  173  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  38.16 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  40.17 
 
 		 272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  38.16 
 
 		 266 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  39.57 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  34.6 
 
 		 279 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  43.41 
 
 		 270 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  34.18 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.61 
 
 		 336 aa  159  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  32.01 
 
 		 327 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  37.39 
 
 		 267 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  35.94 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  37.36 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  36.96 
 
 		 282 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  35.89 
 
 		 339 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  37.83 
 
 		 268 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  35.34 
 
 		 286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  34.22 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  38.1 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  30.57 
 
 		 269 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  30.19 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  37.67 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  34.09 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  39.67 
 
 		 316 aa  135  9e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  48.51 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  33.79 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  31.23 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  33.8 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  49.23 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  43.86 
 
 		 292 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  31.09 
 
 		 293 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.88 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  46.51 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  42.31 
 
 		 249 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  43.12 
 
 		 189 aa  105  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  40.15 
 
 		 292 aa  96.3  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  28.31 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  31.65 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  36.52 
 
 		 197 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  37.88 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  35.34 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  33.57 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  34.06 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  35.11 
 
 		 521 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  34.71 
 
 		 238 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  28.79 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  31.25 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  30.58 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  30.58 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  33.86 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  35.48 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  25.66 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  32.06 
 
 		 556 aa  56.6  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  34.19 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  28.79 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  31.82 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  28.46 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  33.83 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  31.39 
 
 		 267 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.48 
 
 		 206 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  30.37 
 
 		 250 aa  53.9  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  29.51 
 
 		 238 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.62 
 
 		 206 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  26.23 
 
 		 206 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.48 
 
 		 206 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.62 
 
 		 206 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.62 
 
 		 198 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  28.75 
 
 		 216 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.52 
 
 		 206 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.62 
 
 		 206 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.82 
 
 		 243 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  31.62 
 
 		 206 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  28.67 
 
 		 229 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  29.08 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  27.14 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  29.86 
 
 		 262 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  35.24 
 
 		 218 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  33.61 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  28.46 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  28.46 
 
 		 210 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.46 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.46 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  28.46 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.46 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.46 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  26.74 
 
 		 312 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.46 
 
 		 233 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  29.75 
 
 		 218 aa  49.7  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.69 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.69 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  32.59 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  33.06 
 
 		 215 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  29.5 
 
 		 244 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  32.14 
 
 		 238 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  32.14 
 
 		 235 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  29.91 
 
 		 223 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>